Если "кроме драйверов и сторонних программ", то остаётся собственно ядро Linux и то что было разработано командой Manjaro.
С ядром всё понятно, а вот на счёт программ в принципе тоже всё понятно.
Весь исходный код компонентов Manjaro опубликован в их репозитории:
https://gitlab.manjaro.org/explore/groups
Всё не смотрел, но то что увидел, опубликовано было под gplv3