Вы не можете управлять порядком отображения свойств при переборе.
В вашем объекте свойства указаны как число и js всегда будет перебирать такие свойства в порядке возрастания. Можно создать новый объект, но со строковыми именами свойств - тогда они будут в порядке добавления.
var ordered = Object.entries({
4889: "Скрипт ", 4914: "Ааа", 11994: "Сервис", 12344: "иииии", 12417: "Тестовая", 12432: "ТТТ ", 12446: "Ма"
}).sort(
(a,b)=>a[1]<b[1]?-1:a[1]>b[1]?1:0
).reduce(
(a,c)=>{a[`'${c[0]}'`]=c[1]; return a},
{}
);
Object.getOwnPropertyNames(ordered)
// ["'4914'", "'12446'", "'11994'", "'4889'", "'12432'", "'12417'", "'12344'"]