Почему при клонировании репы вылезает сообщение о том, что память не может быть mapped?

Question

[sir_Maverick]

Через shell на хостинге при попытке склонировать репу выдает

-bash-4.2$ git clone [e-mail]:[github-username]/[sitename].git                                                                                                             
Клонирование в «[sitename]»...                                                                                                                                                
Enter passphrase for key '/var/www/[username]/data/.ssh/id_ed25519':                                                                                                            
remote: Enumerating objects: 10154, done.                                                                                                                                     
remote: Counting objects: 100% (3001/3001), done.                                                                                                                             
remote: Compressing objects: 100% (1165/1165), done.                                                                                                                          
remote: Total 10154 (delta 1855), reused 2950 (delta 1831), pack-reused 7153                                                                                                  
Получение объектов: 100% (10154/10154), 994.11 MiB | 11.51 MiB/s, готово.                                                                                                     
Определение изменений: 100% (4444/4444), готово.                                                                                                                              
fatal: packfile /var/www/[username]/data/www/[sitename]/.git/objects/pack/pack-211d5feea74c9707b96ceef6f953aaf98cbdbac5.pack cannot be mapped: Невозможно выделить память                                                                                                                                                                      
warning: Clone succeeded, but checkout failed.                                                                                                                                
You can inspect what was checked out with 'git status'                                                                                                                        
and retry with 'git restore --source=HEAD :/'

Сразу скажу, что на виртуалку с Ubuntu Server 20.04 заливается все нормально, никаких ошибок не происходит.
Пытался отдельно заливать через менеджер папку .git, в таком случает репозиторий не инициируется и невозможно становится в дальнейшем стягивать изменения. Вопрос - размер папки .git около гига, могут быть какие то ограничения на хостинге на копирование больших файлов? Заявка у хостера уже лежит, пока безответно. В чем может быть проблема невыделения памяти в процессе git clone?

Забыл сказать — файлов на хостинге не появляется никаких после данной операции, кроме частично папки .git и ее неполного содержимого.

Answer 1

[Сергей Кузнецов]

Под памятью тут имеется в виду оперативная память. Видимо на хостинге она сильно ограничена.
Тут написано что клонирование прошло успешно и сбой прошел уже на этапе распаковки файлов в рабочий каталог.
Вы пробовали узнать что проиходит через git status?
Ну и сделать как советуют
git restore --source=HEAD :/

Comments

[sir_Maverick]

Да, я тоже думал что связано с оперативной памятью, просто видимо неверно выразился.

git status                                                                                                                                                         
На ветке master                                                                                                                                                               
Ваша ветка обновлена в соответствии с «origin/master».                                                                                                                        
                                                                                                                                                                              
Изменения, которые не в индексе для коммита:                                                                                                                                  
  (используйте «git add/rm <файл>…», чтобы добавить или удалить файл из индекса)                                                                                              
  (use "git restore <file>..." to discard changes in working directory)                                                                                                       
        изменено:      .gitignore
        изменено:      .htaccess
        изменено:      admin/Untitled-1.html
        изменено:      admin/api.php
        изменено:      admin/archive.php
...
длинный список всех файлов проекта
...
  изменено:      webstat/index.072018.html
  изменено:      webstat/index.html
                                                                                                                                                                              
Неотслеживаемые файлы:                                                                                                                                                        
  (используйте «git add <файл>…», чтобы добавить в то, что будет включено в коммит)                                                                                           
        waer-air.com/
                                                                                                                                                                              
нет изменений добавленных для коммита                                                                                                                                         
(используйте «git add» и/или «git commit -a»)

а по факту должно быть up-to-date

git restore --source=HEAD :/ выполняется без вывода
после git restore git status выдает то же самое
в папке с проектом кроме неполной папки .git так ничего нового и не появилось
.git размером 944мб
а актуальная папка .git имеет размер 1.09gb

[Сергей Кузнецов]

а по факту должно быть up-to-date

Не только должно, но и по факту. Тут говорится что ветки совпадают.
Выражение up-to-date не совсем удачно перевели как «Ваша ветка обновлена в соответствии с».

актуальная папка .git имеет размер 1.09gb

Папки не обязаны полностью совпадать. При клонировании скачивается только то, что нужно. Мусор не клонируется.

Можете попробовать ещё другую команду
git reset --hard

И настораживает тот факт, что репозиторий у вас огромный, так не должно быть. Что вы туда закоммитили? Скорее всего попадается слишком большой файл и памяти не хватает для распаковки.

[sir_Maverick]

То, что накомитил лишнего, это я уже догадываюсь) Там попадаются ресурсы типа изображений, плюс история за 2+лет, плюс большое количество текста, но без этого никак.
Меня больше смутил факт что на виртуалке 2гб оперативы все проходит без проблем, видимо на хостинге выделяется совсем мало памяти. Либо это могут быть какие то ограничения в настройках git?

Хард ресет выдает
fatal: packfile .git/objects/pack/pack-211d5feea74c9707b96ceef6f953aaf98cbdbac5.pack cannot be mapped: Невозможно выделить память
Этот файл собственно весит 994мб

[sir_Maverick]

git gc --force выдает
fatal: failed to run repack
по отношению к тому же файлу
Возможно ли это исправить? Или проще проект перенести в новый репозиторий?

[Сергей Кузнецов]

Гонять этот гигабайт истории на хостинг и обратно в любом случае нет никакого смысла.
Предлагаю обрезать историю воспользовавшись рецептом из учебника.
Получится два репозитория, один легкий новый, а второй архивный. При желании всегда можно будет восстановить историю обратно. Основной репозиторий не должен весить сильно больше чем сам сайт.

Ну и вообще не принято репозиторий хранить в папке сайта. Хотя бы закройте доступ к папке .git через .htaccess
И деплоить сайт можно простым копированием файлов, не перенося всю папку .git

[Сергей Кузнецов]

failed to run repack

На локальном компе? Значит репозиторий у вас изначально поврежден и тогда понятна причина ошибки. Гит не может извлечь файлы из поврежденного архива.

проще проект перенести в новый репозиторий?

Да. Удалить репозиторий и инициализировать заново.

[sir_Maverick]

Сергей Кузнецов, нет, git gc делал тоже на хостинге, на локальном переупаковка проходила без проблем.
Спасибо, за ссылку, так и сделаю.