Сделал переадресацию в htaccess, которая должна поддомены переадресовывать с https на http:
RewriteCond %{HTTPS} on
RewriteCond %{HTTP_HOST} ^([^\.]+)\.домен\.ru$ [NC]
RewriteRule ^(.*)$ http://%1.домен.ru/$1 [L,R=301]
В итоге в chrome сначала появляется ошибка "Подключение не защищено", надо нажать "Перейти на сайт поддомен.домен.ru (небезопасно)", и после этого срабатывает переадресация. При индексации ботом гугла происходит то же самое, он видит ошибку "недействительный сертификат".