Сессии сами не создаются, их создает РНР при обращении к сайту.
Сколько обращений - столько сессий.
Соответственно, смотреть надо по двум направлениям
1. проверить, не долбит ли кто-то запросами, и заблокировать или ограничить, например использовать Rate Limit у NGINX
2. файловая система - самое убогое хранилище для сессий, и используется по умолчанию только потому, что для всех других нужно указывать параметры подключения. Соответственно, вместо файлов использовать базу данных.
Плюс надо смотреть по коду. Если сайт создает сессию на откровенно мусорный запрос, то, возможно, этого не стоит делать. Ну и нельзя сбрасывать со счетов гениальных скриптописателей, которые сами себе создают нагрузку на сайт. Не раз и не два я видел любителей инклюдить локальные файлы по HTTP.