1. ID — уникальный номер. В переводе идентификатор.
2. XML_ID - не предназначен для хранения пользовательский значений, в вашем случае "цвет". В этом поле уникальный идентификатор для обращения к значению свойства.
3. Для работы с цветами используют свойство "Справочник".
Переделывайте по нормальному.
Прежнюю нумерацию не вернуть и более того, может это научит вас сразу делать правильно.
Как вариант - откатитесь полностью/частично (для опытных пользователей).