Потому что владельцы магазинов хотят что бы покупали в их магазинах, а не в сторонних приложениях

git reset --hard HEAD

Там где вы применяете $options - ожидается что елементы будут массивом. Поэтому и при присвоении значения и оборачивают значение в квадратные скобки, чтобы получить
$options[$k][0]=$row['value']
если так более понятно то модно сделать

if (!isset($options[$k])) {
          $options[$k][] = $row['value'];
     }