Если я правильно понимаю, то речь идет о мерцании вывода, зачастую это происходит за счет того, что консоль чистят от всего вывода, а потом выводят следующий кадр, а т.к. отчистка консоли относительно долго происходит, то и появляется эффект мерцания. Решается это путем смены алгоритма вывода, не стирать предыдущий результат, а выводить следующий поверх старого, в этом случае мерцания не будет, однако стоит учесть как будет стираться старый результат, который не будет перетираться новым, одним из решением этого, вывод каждого кадра в виде массива.