Я встречался с такой ситуацией, формально все в наличии(все параметры на фронте, в беке, в базе, включая проверку генерации дерева ресурсов в кеш), но фактически ресурса в дереве нет. Ничем не смог это объяснить. Помогло обновление до следующей минорной версии MODX, может и вам поможет - как крайний случай? Вижу у вас версия 2.6.5