Обычным образом в кастомайзер загружаю png, которое в оригинале 2132 на 367 пикселей в хорошем качестве.
Даже чтобы наверняка убедиться, что ничего не режет ему качество, кидаю неоптимизированную версию, она все равно теряет качество.
Структура, ничего особенного.
<div class="col-lg-3 logo-wrapper">
<?php echo get_custom_logo(); ?>
</div>