Создаете файл main.css с содержимым
.br0 {
border-radius: 0px !important;
}
Дальше делаете подключение ПОСЛЕ css twitter bootstrap.
В коде пишите вот так
<span class="btn btn-default br0">Bootstrap</span>
Пример на
JsFiddle
Вообще, изменять less стоит только если надо железно сделать кнопки квадратными, в общем же случае, мой вариант куда практичнее.