$arr = [123456789];
$str = strval($arr[0]); // (strval) нужен если тип данных у элемента числовой. Если число хранится в виде строки, то функция strval не нужна
$newStr = '';
for($i=0;$i<strlen($str);$i++;) {
$newStr .= $str[$i] . ' ,';
}
$arr[0] = $newStr;