Папку — из QueryString, параметр RootFolder (учтите только, что генерить его в последюущих ссылках прийдется вашей веб-части). Фильтр — не понял, что имеется в виду. На страницу вставлена веб-часть фильтра? Тогда ваша веб-часть должна уметь IFilterValues и надо будет связать вашу и фильтр.
Только перед написанием своей веб-части, я бы советовал как следует присмотреться к XsltListViewWebPart. У нее вполне богатый функционал, хотя она и не очень удобна в разработке.