Очень просто - читайте вывод команды
du с ключом
-s
А уже потом принимайте решение, что и как удалять.
leah@leah-pc ~> du -s /var/www/media
131268256 /var/www/media
leah@leah-pc ~>
Можно конечно и на питоне пройтись по всем подкаталогам и считать размеры всех файлов. Но зачем, если уже есть утилита.
import subprocess
proc = subprocess.run(["du","-s","/var/www/media"], stdout=subprocess.PIPE)
folder_size = int(proc.stdout.decode('utf-8').split('\t')[0])
Ну и удалять можно командой
rm