есть специальный сервис pcacct , его надо установить и запустить (и включить как сервис конечно). тогда он будет в специальное место логгировать все команды которые запускаются на компе.
там есть разные утилиты в комплекте, исполнявшиеся команды посмотреть можно как-то так
~# lastcomm --user zabbix | tail -n 10
sh zabbix __ 0.00 secs Thu Sep 23 03:38
grep zabbix __ 0.00 secs Thu Sep 23 03:38
awk zabbix __ 0.00 secs Thu Sep 23 03:38
who zabbix __ 0.00 secs Thu Sep 23 03:38
sh zabbix __ 0.00 secs Thu Sep 23 03:38
grep zabbix __ 0.00 secs Thu Sep 23 03:38
mount zabbix __ 0.00 secs Thu Sep 23 03:38
sh zabbix __ 0.00 secs Thu Sep 23 03:38
wc zabbix __ 0.00 secs Thu Sep 23 03:38
who zabbix __ 0.00 secs Thu Sep 23 03:38
ну вообще там много - читайте доки