Сайт может быть:
• преимущественно настольный (Посмотре.ли);
• преимущественно мобильный (Эгея. Или вот знакомая пишет внутреннюю систему учёта отпускных — всё сделано, чтобы работало с мобилы);
• адаптивный (Розетка — простите, я с Украины. Ну и Хабр Q&A);
• с сильно разными шкурками под настольный и мобильный (Википедия, YouTube)
Какие факторы на это влияют:
• Умение веб-программиста — что он умеет, то и пишет.
• Используемый инструментарий — скажем, у нас есть древний сайт, надо переписать под мобилу.
• Соотношение «настольный/мобильный» — например, заказ пиццы обязательно делать преимущественно мобильным или адаптивным.
• Контент — если много картинок, приходится думать. И наоборот, простой блог без проблем можно сделать преимущественно мобильным, что и сделал Бирман в своей Эгее.
• Особый настольный инструментарий — например, вики смотрят и с мобилы, но редактирование с мобилы — крайне редкий сценарий и обычно ограничивается редактурой. YouTube с мобилы много глазеют, но залить с мобилы — дело значительно более редкое. И уж совсем редкое — управлять видеоблогом с мобилы.
Кодовая база общая, разные только шкурки.