К вопросу запуска программ Windows через Java, можно глянуть сюда:
Как запускать программы через cli на Windows -
https://superuser.com/questions/494538/how-do-i-op...
К вопросу, как выполнять команды в cmd -
https://stackoverflow.com/questions/15464111/run-c...
Посмотрите на классы Process & ProcessBuilder. По ссылке выше показан пример их использования
Или браузер например открыть.
Зависит от того, с какой целью вы хотите открыть браузер. Если подразумевается дальнейшая работа с браузером из кода (например, тестирование, парсинг или еще что...), то гляньте на Selenium.
https://www.browserstack.com/guide/run-selenium-te...
Гуглим -
java selenium {ваш_браузер}