А пытались каким образом зашифровать при помощи TrueCrypt? Чисто из под Windows или же вариант поставить TrueCrypt на MAc OS X и зашифровать вообще ведь диск со всеми разделами тоже пробовали?
Не утверждаю, но, по моему, может получиться.
Или есть какая-то необходимость зашифровать именно раздел Windows, не трогая остальное?
Плюс есть
www.diskcryptor.net/wiki/Main_Page
Сам не пробовал, вроде как аналогичен TrueCrypt по функциональности. Недавно только о нем узнал, ещё руки не дошли проверить.
