На обоих серверах устанавливаете rsync:
yum install rsync
На сервере-источнике редактируете /etc/rsyncd.conf:
uid = root
use chroot = no
[RootFS]
path = /
read only = yes
hosts allow = ip-адрес нового сервера
и запускаете
/etc/init.d/rsyncd start
На сервере-приемнике создаёте каталог /home/oldserv и выполняете команду:
rsync \
--archive \
--hard-links \
--inplace \
--numeric-ids \
--delete \
--delete-excluded \
--progress \
"--exclude={/dev/*,/proc/*,/sys/*,/tmp/*,/run/*,/mnt/*,/media/*,/lost+found,/home/*/.gvfs}" \
"$IP-старого-сервера::RootFS" "/home/oldserv/"
Запускаете её снова до тех пор, пока время выполнения не перестанет уменьшаться.
На старом сервере выполняете
/etc/init.d/rsyncd stop, в /etc/rsyncd.conf комментируете секцию «RootFS».
