Добавьте новый пункт меню в 1с и запустите полную выгрузку, проверьте появился он на сайте или нет. Убедитесь что фаилы загружаются на сайт и у них всё хорошо с правами, гляньте в логи навсякий случай и прочтите про новое обновление 1с которое у вас накатилось, возможно там есть описание изменений в формате выгрузки. Проверьте версию модуля обмена на стороне битриска, возможно тоже стоит обновить. А дальше уже дебажить код...
