Здравствуйте!
А где "groupBox" добавляется в окно? Сделал простенький вариант с классном на основе QWidget. Всё отображается как надо.

import sys
from PyQt5.QtWidgets import QApplication, QWidget, QGroupBox, QVBoxLayout, QLabel, QPushButton

class Example(QWidget):
    def __init__(self):
        super().__init__()
        l = QVBoxLayout()
        b = QPushButton('Добавить без параметра!')
        b.clicked.connect(lambda: self.function1())
        b2 = QPushButton('Добавить с параметром!')
        b2.clicked.connect(lambda: self.function1(args='параметр'))
        l.addWidget(b)
        l.addWidget(b2)
        self.setLayout(l)
        self.show()

    def function1(self, args=None):
        groupBox = QGroupBox("Титле")
        vbox = QVBoxLayout()
        vbox.addStretch(1)
        groupBox.setLayout(vbox)

        integerLabel = QLabel('test')
        vbox.addWidget(integerLabel)
        print('свойство сейчас:' + integerLabel.text())
        if args is not None:
            integerLabel.setText('1')
            print('Тест попадения функции')
            print('Поменялось на:' + args)
        print('свойство сейчас 2:' + integerLabel.text())
        self.layout().addWidget(groupBox)


if __name__ == '__main__':
    app = QApplication(sys.argv)
    w = Example()
    w.resize(250, 150)
    w.setWindowTitle('Simple')
    w.show()
    sys.exit(app.exec_())

В своем приложении вы описываете объекты хранения в виде ООП классов. Далее, при работе с этими объектами в Python, система ORM транслирует объектные взаимодействия в SQL в соответствии с указанным провайдером.
Например, print(Person[person_id].name) сгенерирует следующий SQL код для SQLite:

SELECT "id", "name", "age"
FROM "Person"
WHERE "id" = ?

Где вместо вопроса подставит указанный person_id. Он выполнится в SQLite, вернет данные в ORM и она уже выдаст нам запрошенные данные в виде объекта Person, из которого в данном случае мы выводим имя.
И это будет работать так независимо от того, первый раз вы запускаете приложение или сотый.
На официальной странице Pony ORM все довольно понятно расписано в разделе первые шаги:
Getting Started with Pony
Для понимания взаимодействия ORM с базой данных советую включить отладочный режим: set_sql_debug(True). В это случае в консоль будет выводиться все взаимодействие с БД.

Есть ещё вариант использовать CollectionViewSource:

CollectionViewSource _viewSource = new CollectionViewSource();
_viewSource.Source = _items;
_viewSource.Filter += (s, e) =>
              {
                  SomeItem item = e.Item as SomeItem;
                  bool accepted;
                  //проверяем наши условия. true - объект отобразится, false - не отобразится
                  e.Accepted = accepted;
              };

Чтобы обновить список элементов используем:
_viewSource.View.Refresh();
После этого для каждого элемента из _items вызовется событие Filter.
Соответственно в ComboBox.ItemsSource биндим _viewSource.View. Таким образом в ComboBox не придется каждый раз вручную вставлять новую коллекцию.