Смотря, какие цели преследовать.
Ubiquiti - чисто wifi, ничего лишнего. По настройке - обычный линух внутри. Никаких хитростей с маршрутизациями, коммутациями в них нет. Нет и не будет никаких BGP, OSPF, расширенной таблицы маршрутизации, всяких L2 фич. Очень хорошо подходят для дешевых радиомостов в различных топологиях.
Mikrotik - wifi в основном побочная фича. Это больше маршрутизаторы. Поддерживает очень много всего для устройства такого уровня. Но с wifi-ем грустно - нет встроенных инструментов измерения спектра, кривая технология WDS (может уже поправили), нет плюшечек типа airomax, нет MIMO. Возможно этого и не будет.
С другой стороны, если нацеливаться на беспроводные сети, возможно стоит выбрать курсы производителя каких-нибудь РРЛ или более профессионального оборудования (например, aruba)? Подороже, но они заточены под беспроводные цели.