Если используешь Api goole, то нужно отключать скролл через опции, при инициализации карты.
Если же карта созданная через конструктор и грузится в iframe, то вырубаешь стилем действия мыши:
iframe {
pointer-events: none;
}
На сам айфрем навешиваешь обработчик клика, который при клике меняет css.
$('iframe').click(function(){
$(this).css('pointer-events','auto');
})