Могли оставить какой-нибудь скрипт, который по запросу из сети выполнить любой заранее заложенный или загруженный в процессе код. Могли майнер оставить. Могли какой-то сервис развернуть. Могли в крон положить скрипт который через Х дней даст доступ по ключу или добавит пользователя. А могли ничего не сделать. Вариантов слишком много :) Проще переустановить. Логи могли и подчистить.