xseven

Умение формулировать вопрос эт оуже 70% успеха и возрастание вероятности получить ответ почти до единцы.

Данный вопрос выглядит как: "что вы больше меньше всего любите потому что за позавчера?"

В общем виде если модель не отображается напрямую однозначно (разное количество элементов, какие-то особые критерии отображения и т.д.), то желательно использовать одну из моделей прослоек (QIdentityProxyModel, QSortingProxyModel и т.д.)

Если вы сформулируете ваш вопрос более конкретно, то будет легче ответить предметно.

Все в порядке с разработкой программ под настольные системы. То что многие оттягиваются писать свистки для телефонов или паутины, говорит лишь об их возросшей популярности, а вовсе не об упадке дел в разработке для настольных систем.
Плюс рынок наукоемких приложений вполне себе растет, да много можно напридумывать. Но наверное какие-то простые приложения для развлечений - да будут переходить на мобильные устройства.

Судя по всему, не помешало бы добавить layout чтобы растянуть ваш дочерний виджет внутри родительского.

В конструкторе родительского виджета можно добавить:
setAttribute(Qt::WA_TranslucentBackground);

Должно помочь.

При редактировании вызывается из делегата createEditor (создается поле для редактирования), setEditorData(назначаем значение полю для редактирования) , setModelData(редактирование окончено сохраняем занчение в модель). Эти функции стоит переопределить

Почитать можно тут

Вы создаете немодальный диалог вызывая show()
Если я правильно понял, то:
Попробуйте вызвать exec() вместо show(), тогда окно станет модальным и не закроется пока вы не завершите необходимые действия в нем.

Сложно сказать, что работает медленно не видя всего кода.
Для начала я бы посоветовал пройтись профилировщиком + дать ссылку на код если возможно.

Вообще несколько странный подход на мой взгляд.
Почему не используется removeRows/removeColumns и их антагонисты insert?
Если так хочется removeById почему не вывести это в виде адаптора?
Несколько проще на мой взгляд по максимуму использовать возможности интерфейса стандартной модели.
Плюс как вычисляется индекс и где сигналы dataChanged? Вы видимо поэтому используете посылку сигналов для layout. Т.к. без посылки dataChanged не стоит надеяться на правильное отображение или выделение.

Типовой вроде вопрос:
qt-project.org/forums/viewthread/34935

Вообще более продвинутый подход будет:
Использовать QTableView
Переопределить делегат
Модельку

И обрабатывать события и т.д.
Но желательно описать задачу более подробно

А в общем случае

правильно понимаете что нужен QGridLayout )

Можно сделать почти все из желаемого

Нужно унаследоваться от QStyledItemDelegate

1. Размер ячейки (максимально желаемый) выдается от делегата с помозью метода sizeHint
При работе с ним есть какие-то тонкости, но если добавить метасвойства к данным то можно менять размеры (но в разумных пределах)
2. Выделение нужно смотреть в методе делегата paint
Например я сделал так

void myClass::paint(QPainter *painter, const QStyleOptionViewItem &option, const QModelIndex &index) const
{
...
//[In case of selection override colour to selection color except mean row]
    if(QStyle::State_Selected & option.state)
    {
        QColor selectedColor = QApplication::palette().color(QPalette::Highlight);
        cellBrush = QBrush(selectedColor);
    }

    //[Fill background]
    painter->fillRect(itemRect, cellBrush);
}

Ну и т.д

Желательно прочесть:
qt-project.org/doc/qt-4.8/model-view-programming.html

Смущает сама постановка задачи.

В Qt нет никаких возможностей для работы с большими файлами (если не ошибаюсь были обертки над mmap для *nix и аналогом для Win)

В общем случае вам надо отобразить большой файл в память для чтения
Отобразить файл для записи
Читать и писать из источника в приемник
Подход вполне жизнеспособен (существуют альтернативы)

Можно посмотреть в сторону HDF5