Попробую предположить, что какой-то порт sata конфилктует с m2 слотом. У меня на m/b от asus прямым текстом написано, что если m2 подключен, то какой-то sata порт (6й вроде) работать не будет.
Так что попробуйте переставить ваш сата ссд в другой порт просто.