Конечно кому как удобнее, но я бы предпочел линукс, дебиан+самба+консоль, если опыта маловато то freenas и подобные дистрибы, можно попробовать поломанную синолоджи. С виндой проблем больше, то обновится не вовремя, то вирусов нахватает, то тупо затормозит на пустом месте.
