Я наоборот разделяю исходники, вплоть до отдельных sass файлов для шапки, контента, сайдбара и т. п.
Еще я разделяю html-файлы и include их потом. Комфортнее работать с кодом, который умещается на 1-3 скролла в редакторе.
Но в продакшен идет один объединенный минифицированный css-файл.
А те, кто так не делают, просто индусы или типа того)
Либо, как вариант, ориентация на поддерживаемость кода без исходников. (Не все знают про препроцессоры, например)