30-40 метров самообжатого патчкорда или чего?
первое что сделать - переобжать концы - на какой-то из жил плавающий неконтакт или окисление, вот переодически и падает скорость.
Можно попробовать выставить на портах жестко гигабит без автосогласования, тогда скорее всего будет падать все соединение, но быстрее восстанавливаться.
второе смотреть трассу, возможны еще какие-то наводки
