если хотите централизованную, то mercurial
Другое дело что вы хотите, по-моему, другого.
Система контроля версий - это средство коллективной разработки.
А судя по словам "количество версий", вам нужен каталогизатор.
Хотя возможно я просто не так понял и вам нужно именно что мержить результат работы разных разработчиков.
