Почему первое модальное окно не закрывается jsfiddle внутри?

Обрати внимание на поиск кнопки close - он должен осуществляться у конкретного окна.
Делал похожую штуку в виде модуля: https://github.com/rideorgtfo/ksystems

Почему первое модальное окно не закрывается jsfiddle внутри?

https://jsfiddle.net/p5qo4c7f/4/

Почему первое модальное окно не закрывается jsfiddle внутри?

Советую оформить в JsFiddle, чтобы можно было помочь на реальном примере.
А так, нужно смотреть в консоль, анализировать что происходит.