Для гнома реально ничего лучше наутилуса нет. Когда жил на винде всегда пользовался тоталкомандером, ибо проводник это УГ. И на линуксе по инерции тоже пытался использовать файловый менеджер типа крусадер и даблкоммандер. последний является точной копией тотала, правда у он еще в разработке. Но потом я узнал про клавишу F3, и возможность использования закладок и понял, что это то что мне нужно. А потом я узнал про разные плагины к наутилусу и моему счастью не было предела. Особенно нравится наутилус-терминал. Показывает консоль прямо в окне наутилуса. :)