Конечно можно, обмен и не будет затрагивать созданные вручную элементы, если вы (один из вариантов):
1) Выгружаете данные из 1С в режиме изменений
2) Если используете полную выгрузку, то выключите в настройках "Что делать с товарами, отсутствующими в файле импорта" (тут /bitrix/admin/1c_admin.php?lang=ru)
Ну и третий вариант, если ничего из предложенного выше не помогло - это добавить обработчик на событие изменение элемента и перед тем, как его менять установить проверку: если запрос пришел из обмена и допустим внешний код элемента равен ID элемента (обычно если элемент создан вручную, то внешний код элемента равен ID элемента) то пропускать его изменение.
Mikhail K, пока не очень понятно не работает совсем двухсторонний обмен или только корзины. Можете создать заказ в интернет-магазина, выгрузить его в 1С, на стороне 1С изменить статус заказа и выполнить обмен заказами?
Ожидаемый результат:
В интернет-магазине статус заказа изменился на тот, который был установлен в 1С.
Если этот кейс работает, то надо будет смотреть дальше.
1) Выгружаете данные из 1С в режиме изменений
2) Если используете полную выгрузку, то выключите в настройках "Что делать с товарами, отсутствующими в файле импорта" (тут /bitrix/admin/1c_admin.php?lang=ru)
Ну и третий вариант, если ничего из предложенного выше не помогло - это добавить обработчик на событие изменение элемента и перед тем, как его менять установить проверку: если запрос пришел из обмена и допустим внешний код элемента равен ID элемента (обычно если элемент создан вручную, то внешний код элемента равен ID элемента) то пропускать его изменение.