Վիտալի Լագունով

1. Не сказана, какая нагрузка на сервер. Может быть, в этот момент процессор или диск загружен на 100% — поэтому и тормозит.
2. Если Вы уже прошлись по всем узким горлышкам, и видите, что нигде загрузки нет, вероятно, у Вас просто неправильные настройки. Например, в nginx по умолчанию стоит очень маленькое количество соединений, и как только к Вам подключится такое количество пользователей, всё начнёт виснуть. Например, если worker_processes стоит 2, а worker_connections — 1000, то nginx сможет одновременно обслуживать не больше 2000 запросов, остальные запросы будут ставиться в очередь. Решение — поставить их на максимум (сколько не жалко оперативки). Соединение отъедает где-то 10 КБ памяти, поэтому если Вы поставите 100 тыс соединений, то nginx сможет отожрать до 1 ГБ памяти.

С изменением пути:

return 301 https://example.com/newPage$is_args$args;

Без изменения пути:
return 301 https://example.com$request_uri;

Если же имелось ввиду проксирование, то:

proxy_pass        http://…;
proxy_set_header  Host <подставить>;
proxy_set_header  Connection "";

# Также если нужно изменить путь, то, возможно, нужно добавить rewrite:
rewrite .* /newPath;

Попробуйте так:

if ($args ~ "(&|^)_escaped2A_fragment_(?:[&=]|$)") {

И как Вы составляете запрос к своему серверу?

nice -n10 ionice -c3 command arg1 arg2 arg3