переместите папку ZenCodingPython в %AppData%\Roaming\Notepad++\plugins\config
именно там настройки, а не в Program Files
%AppData%\Roaming\Notepad++\plugins\config\ZenCodingPython\zencoding\zen_settings.py
%AppData%\Roaming\Notepad++\plugins\config\ZenCodingPython\zencoding\my_zen_settings.py
+Опции > сочетание клавиш > плагины > Expand abbreviation > Ctrl+E