Находишь кнопку в коде и задаёшь id (атрибут "id="твой любой id")
В js с помощью getElementById("твой id кнопки") добавляешь кнопку в переменную. Точно также делаешь с цифрой которая меняется.


Пример (Updated):

HTML:

<div id="counter">
<input type="button" id="buttonCountPlus" value="+">
<div id="buttonCountNumber">1</div>
<input type="button" id="buttonCountMinus" value="-">
</div>

<div id="calculation">150</div> // 150 просто число для наглядности вычисления

JavaScript:

let calculate = document.getElementById("calculation");
let count = document.getElementById("buttonCountNumber");
calculation = document.getElementById("calculation").innerHTML;

document.getElementById("buttonCountPlus").onclick = function() {
  let countPlus = count.innerHTML;
  if(+countPlus <= 3){
    count.innerHTML++;
    let countPlus = count.innerHTML;
    calculate.innerHTML = calculations(countPlus) ;
  }
}

document.getElementById("buttonCountMinus").onclick = function() {
  let countMinus = count.innerHTML;
  if(+countMinus >= 2){
    count.innerHTML--;
    let countMinus = count.innerHTML;
    calculate.innerHTML = calculations(countMinus) ;
  }
}

calculations = (count) => {
  return calculation+` * ${count} = ` + (+count)*(+calculation);
}

Это происходит потому что у тебя в начале проходит цикл до того момента пока i не становится равной 3, но при этом addEventListener не срабатывает (он работает только при клике).
А когда ты кликаешь срабатывает addEventListener где i уже равно 3