Можно использовать таймер-счётчик в режиме CTC с переключением вывода OCnA по совпадению с регистром OCRnA. Для таймера-счётчика 1 Arduino Leonardo это вывод Digital 9.
#include <ve_avr.h> // Используется библиотека VE_AVR
#define PIN_OC1A 9 // Пин Digital 9 - OC1A
void setup() {
DEV_TIMER1.setWaveGenMode(TimerW::CTC_OCRA);
DEV_TIMER1.setClockSelect(TimerW::Prescaler_1); // PR = 1
DEV_TIMER1.setOutputCompareA(39); // 16e6/(2*PR*(1+39)) = 200 kHz
DEV_TIMER1.setCompOutModeA(TimerW::Toggle);
pinMode(PIN_OC1A, OUTPUT);
}
void loop()
{
}
Библиотеку VE_AVR можно
скачать здесь.