Если просто нужен мега-универсальный инструмент типа, назовём его "блокнот", с высокой кастомизируемостью, то идеально подойдёт
Notion.
Категорически рекомендую, пользуюсь сам и довольно давно, причём заточил для различных нужд. Бесплатной версии хватает на любые по сложности структуры + хранение документов. Опять же – никто не отменял запароленные архивы и шифрованные файлы, они крепятся к любым записям.
