Разобрался сам. Как написано в этой статье
glenmaddern.com/articles/css-modules - "сomposition is everything". Это значит, что я не правильно понял метод. До этого я применял в проектах яндексовский БЭМ. В их варианте есть модификатор - дополнительный класс для основного класса. В CSS-modules такого нет и каждый класс отдельный и составляется из других классов. То бишь если мне нужна обычная кнопка, то я использую класс buttons.default содержащий базовый стиль. Если нужна обычная большая, то buttons.defaultBig.
