Только по факту параметров больше и сложность взаимосвязей между ними выше.
Вроде simulink в матлабе как раз про это.
Ещё можно digital twin загуглить.
PS: что именно имелось в виду под "функционально-объектно-ориентированное моделирование" я не понял. Звучит как выдуманный термин