unsafePtr

Сразу WebApi

Объявить конструктор у формы с параметром и вызывать его в Main

public MainForm(string parameter) : this()
{
   this.Parameter = parameter ?? String.Empty;
}

Как насчёт .net core. Только подождите второй версии, весной должны выйти в свет.

Service Pattern + Inversion of control. Из слоя сервиса возвращаем Dto(Data transfer object), всегда, раз уж следовать по канонам. Хочешь вернуть Team с Player просто в сервисе создаешь метод и в теле функции реализуешь логику

List<TeamPlayer> GetTeamPlayers(int teamId)
{
  //logic
}

Попробуй использовать структуру вместо класса.

есть встроенные node в visualstudio, его надо обновить. Ну и как бы нету значения какой проект, добавляешь package.json, ну а дальше из конзоли. А конзолька часто может понадобиться что бы установить новый пакт, могу посоветовать добавить это расширение

Entity(сущность) должны представлять нашу таблицу в БД, и идеологически должна включать в себя все столбцы таблицы. Для взаимодействия с нашем слоем доступа к данным, используем DTO(data transfer object), именно здесь мы уже выбираем нужные нам свойства сущности, здесь же располагается наша бизнес-логика. Довольно часто такой DTO класс является полной копией Entity. К сожалению от этого ни как не избежать, если мы пытаемся сделать слои максимально независимыми между друг другом.
Добавлю ещё, что возможно вы сталкивались с паттерном Repository, так вот, не используйте его! Repository был придуман лет 20 назад, и туда обычно складывали SQL-заявки. В приложении в нём обычно нет смысла, так как ORM, в данном случае Entity Framework, берёт всю эту работу на себя, и все заявки мы пишем на LINQ. Repository имеет смысл, если мы собираемся писать SQL-заявки вручную, или же используем более одной БД.

Хотелось бы увидеть диаграмму из бд и более точное постановление задачи.
Из того что дано приходит на ум:

var nodes = repository.Users
                .Include(u => u.Nodes)
                .Include(u => u.Targets)
                .Where(u => u.Id == 25)
                .SelectMany(u => u.Targets)
                .Include(t => t.Users.Select(u => u.Nodes))
                .SelectMany(t => t.Users)
                .SelectMany(u => u.Nodes)
                .ToList();