Никакой тут проблемы нету. Есть непонимание как работают разные сущности — серверная и клиентская.
php выполняется не в браузере, а на сервере и отдаёт через веб-сервер сорсы для браузера, а далее, в браузере вступает в игру javascript (если включён).
в вашем случае, единственная возможность исполнить сначала js — это загрузить страничку, а потом аяксом сделать запрос на сервер к скрипту php.
