Shift + Tab может "детабулировать" выделенный блок - но это зависит от редактора, где набирается

var a = '1,2,3,4,5';
b = a.replace(/\d/g, function(n){if (n == '1') {return 3} else if (n == '3') {return 2} else if (n == '2') {return '4'} else {return n}});
>> "3,4,2,4,5"

Воспользуйтесь функцией для замены. Функцию, естественно, лучше оформить красивее :)

Для замены через регулярное выражение берём каждый одиночный символ из набора цифр, а из функции (второй аргумент replace) получаем значение, на которое нужно найденный элемент (аргумент n в функции для замены) заменить.