Подскажите пожалуйста приложение, которое может просматривать TCP-пакеты какого-то определенного процесса

ну, естественно для данного примера должна существовать группа nflog и все соотвествующие модули ядра netfilter
кроме того можно не dumpcap а напрямую использоать wireshark

Происхождения diff файла

open-vcdiff прекрасно его обработал.

проще xdelta3 воспользоваться, оно обычно есть в дистрибутиве. (xdelta3 использует VCDIFF формат)

Нужно скомпилировать MonoDroid-приложение?

Ну, они также предлагают:

We offer an unconditional 30-day money-back guarantee.

Проблемы с лимитами GAE, почему завышенны Datastore Read Operations?

ну это так и есть. appstats показывает только количество RPC запросов а не количество элементарных операций БД (которые и учитываются для квоты)