Если ты на godot 4 то тут изи. Заходишь во свойства AnimationPlayer, далее во вкладке Playback options еслть свойство default blend time и меняйте это значение например на 1 секунду и через это время текущая анимация будет смешиваться со второй анимацией и в итоге получится плавное перехождение анимации