На 90% уверен, что в системе два и более видеовыхода. Например, аналоговый (VGA) и цифровой (HDMI, DVi, LVDS...)
При этом часть отображается на неиспользуемый видеовыход. Можно либо туда что-то подключить и будет видно, и там настроить какой экран главный будет, либо... попробовать после загрузки отключить (вытащить кабель VGA) и подключить, возможно что выведет всё на него дублированием.
Это бич почти всех дистрибутивов линуксов, что нигде не могут нормально сделать определение экранов и чтобы можно было вызвать окно настройки на любом экране (просто никто видимо не тестировал такие случаи).
