QT абстрагирует программиста от особенностей операционной системы практически полностью, собственно для этого она и разрабатывалась.

Когда в резюме указывают «Unix программист» я думаю что подразумевается человек, имеющий представления об основных технологиях, используемых в unix-like системах. Это прежде всего представление о том что такое POSIX, Стандарт иерархии файловой системы ru.wikipedia.org/wiki/FHS, основы bash-скриптинга. И еще много мелочей которые способны сильно облегчить жизнь и сделать архитектуру приложения проще и элегантнее.