если я правильно понял вопрос
пкм на рабочем столе -> создать ярлык для запуска здесь -> там откроется окно, поставить галку на открыть в терминале, разделе команда прописать python3 <путь до скрипта>
даблклик по появившейся иконке - и скрипт должен запуститься