Игорь Тимошенков

Я бы делал через filter:

• Добавить в проект https://github.com/Tucker-Eric/EloquentFilter
  
• Выполнить php artisan model:filter App\\Employe
  
• В созданном фильтре добавить нужные методы для фильтрации по relation-у (он это умеет, смотрите документацию)
  
• В контроллере поправить
  

public function index(Request $request) {
     return Employe::with('tags')
          ->filter($request::all())
          ->paginateFilter($request->get('limit'));
}

1. Попробуйите использовать Laravel Debug Bar - в нем прям сразу показывает все ошибки, роуты, запросы в БД и прочее. Сильно упрощает разработку.
   
2. А зачем вы переопределяете контроллер регистрации - поле добавить? Просто это можно было бы сделать через обработку стандарного события регистрации \Illuminate\Auth\Events\Registered. Документация
   

Пользователь инжектиться в Policy автоматически, вас надо только указачть что вы ходите сделать и с чем:

$this->authorize('view', $roles);

Судя по официальной документации, пока никак: https://laravel.com/docs/5.6/database