Если речь всё-таки про общедоступные мессенджеры, то безопаснее там обычно, где меньше аудитория. Меньше аудитория - меньше внимания - меньше шансов, что кто-то там будет ковыряться. Ещё вариант пользоваться сообщениями там, куда в целом не очень дотягиваются руки - типа твиттера. Но с точки зрения протоколов, шифрования и прочего всё можно взломать и прочесть )) Сначала определитесь с целью что и от кого будете защищать. Если корпоративный мессенджер выбираете, то реально лучше On-premise-решения вроде MyChat
